A partir de l'année modèle 1963, la GS 160 subit un lifting. La selle se présente désormais en bleu foncé. Le petit compartiment au-dessus du feu arrière a disparu et un grand coffre à bagages se trouve désormais dans le bouclier de jambe. Le moteur reste inchangé, seul le boîtier du filtre à air et, par conséquent, l'alimentation du carburateur sont modifiés. Toutes les GS 160 sont livrées en gris blanc plombé (code MaxMeyer 1.298.8714).
Le moteur est encore commandé par des pistons. Le cylindre a un alésage de 58 mm et un arbre à joues pleines de construction massive avec une course de 60 mm. Le carburateur utilisé est un Dell'Orto SI 27/23, dont l'alimentation sera modifiée à plusieurs reprises au cours de la construction. Le moteur fonctionne de manière très souple et tire proprement dès les bas régimes. Ici aussi, les conditions en Italie ont dû être une fois de plus extrêmement favorables lors de la détermination de la vitesse maximale, ainsi les 100 km/h sont tout de même assez optimistes.
Le cadre et toutes les pièces de tôlerie sont identiques à ceux de la GS 160 série 1. La suspension avant est, comme plus tard sur la série PX, avec la suspension et l'amortissement en un seul élément. Pour la première fois, la roue de secours de série est logée sous le capot latéral gauche et cachée par un cache métallique semi-circulaire. Des baguettes décoratives en aluminium sur les capots latéraux et l'aile avant permettent d'alléger la ligne sur les pièces de tôle massives. Dans l'accès, on trouve le tapis en caoutchouc bien connu des petits modèles.
Numéros de châssis par année de construction :
1963 : VSB1T 29971-48250
1964 : VSB1T 48251-61000